Русский ботаник, академик Петербургской АН (с 1853). Родился во Фрейбурге (Германия). Окончил Пражский университет (1836). С 1839 работал в России в Ботаническом музее в Петербурге (с 1855 - директор), одновременно был старшим помощником директора Ботанического сада (1851 - 1855) и профессором Педагогического института (1854 - 1859).

Основные научные работы посвящены изучению флоры России. На основании материалов, собранных им во время путешествий по северу России (1841) и Кавказу (1860 - 1861), а также материалов других исследователей опубликовал ряд систематических и флористических работ по флоре Урала и Сев. России, Кавказа, Тянь - Шаня, Петербургской губ. и т. д. Ему принадлежат работы по систематике злаков (ковылей, бамбуков и др.), колокольчиков и первоцветков Кавказа, зонтичных Камчатки. Автор классических исследований по водорослям Тихого океана и Охотского моря. Обосновал связь между образованием чернозема и развитием степной растительности.

Почетный член Петербургского общества естествоиспытателей (с 1869). Член Московского общества естествоиспытателей (с 1868) и Королевского научного общества в Упсале (с 1856). Член - корреспондент Баварского ботанического общества в Регенсбурге (с 1841) и ряда других отечественных и зарубежных научных обществ.

Его именем назван род Ruprechtie из сем. Роlegonaceae.