Швейцарский врач и ботаник. Родился в Базеле. Получил образование в университетах Базеля, Падуи (Италия) и Монпелье (Франция). С 1588 - профессор ботаники и анатомии, с 1614 - профессор медицины Базельского университета.

Один из первых систематиков растений. Изучил и описал около 5000 растений. Разделил их по сходству признаков на 12 «книг» (групп или классов), каждую «книгу» - на секции, секции - на роды, роды - на виды. В целом правильно классифицировал естественные группы (напр., однодольные) и роды. Разграничил понятия рода и вида, дал большинству видов двойное название; таким образом, одним из первых применил в ботанике бинарную номенклатуру, окончательно введенную К. Линнеем.

Его именем назван род баугиния.