Французский микробиолог и химик, член Парижской АН (с 1862), Французской медицинской академии (с 1873), Французской академии (с 1881). Родился в Доле (Юра). Окончил Высшую нормальную школу в Париже (1847). Профессор Страсбургского (с 1849) и Лилльского (с 1854) университетов, Высшей нормальной школы (с 1857), Парижского университета (с 1867). С 1888 - первый директор научно - исследовательского микробиологического института (Пастеровского института),созданного им на средства, собранные по международной подписке.
Научная деятельность относится к различным областям микробиологии, иммунологии, биохимии, стереохимии. Исследовал процессы брожения и гниения, этиологию ряда инфекционных болезней животных и человека и методы вакцинации против них. Доказал, что брожение и гниение - биологические процессы, протекающие под влиянием ферментов микроорганизмов (1857), опровергнув тем самым химическую теорию брожения Й. Я. Берцелиуса, Э. Митчерлиха, Ю. Либиха. Открыл (1861) возбудителей маслянокислого брожения - облигатные анаэробные бактерии, живущие и развивающиеся без доступа кислорода. Ввел (1872) понятие об анаэробиозе. В серии классических экспериментов (1860 - 1861) показал невозможность самозарождения микроорганизмов. Разработал (1865) способ обеззараживания пищевых продуктов путем их нагревания, названный позднее пастеризацией. Выдвинул и обосновал понятие о специфичности микроорганизмов. Проведенное им изучение болезней шелковичного червя и разработка (1870) методов борьбы с этими болезнями положили начало его исследованиям в области иммунологии. Выделил возбудителей сибирской язвы (1881), краснухи свиней (1882), бешенства (1885) и др. и разработал на основе развитого им представления об искусственном иммунитете методы предохранительных прививок против этих, а также других болезней. Осуществил (1885, совместно с П. П. Э. Ру, Ж. Транше) первую антирабическую прививку человеку. Заложил научные основы виноделия, пивоварения и других отраслей пищевой промышленности. Один из основоположников медицинской микробиологии, иммунологии, стереохимии.
Почетный член Петербургской АН (с 1893) и академий наук многих стран мира.